头皮毛囊炎如果发生的并不太严重，而且只是散在性的毛囊炎，有的人可以自愈，特别是患者的免疫力自然恢复，或者患者的生活作息时间比较规律，随着自身抵抗能力增强可能会自愈，不需要进行治疗。但是如果毛囊炎的发生面积较大，而且有明显的化脓性感染，还是需要进行治疗的。这种毛囊炎有两种情况，最常见的可能是细菌感染而形成的毛囊炎，这时候还需要进行抗菌治疗，可以局部外涂夫西地酸乳膏或者外涂龙珠软膏，同时还需要口服抗生素，比如可以口服罗红霉素、多西环素或者美满霉素等等。但如果是真菌性毛囊炎还需要进行抗真菌治疗，比如可以口服伊曲康唑\n等。
其实在患有脱发性毛囊炎时，必须要通过服用药物的方式，更好地针对身体内部干预治疗后，才能有效取得治疗性效果。这种疾病虽然看起来似乎不那么严重，但这种炎性疾病的存在现象，只会有所加重却无法让身体自行消除，所以脱发性毛囊炎并不具备自愈的几率。要知道在毛囊位置存在炎性反应时，只会造成组织实质损害，且影响到发根方面的生长现象，这种损害程度只会随着时间推移而日益加重。
毛囊炎是毛囊细菌感染性炎症，可以是单发，也可以是泛发，可以是局部皮肤问题，也可以系统疾病的皮肤表现。比如男孩运动以后出汗比较多，或者出油比较多，局部毛囊发生炎症改变;也可以由于内科疾病，比如糖尿病病人反复出现毛囊炎，或者是白塞氏病，或者是有些内科疾病，就可以出现毛囊炎损害。但是做病理，毛囊炎不是真毛囊炎，是血管炎性损害，根据不同损害不同原因导致的毛囊炎，治疗原则是不一样的，但是大多数是细菌感染性，首先是抗菌消炎治疗，可以局部外用消炎药膏，严重泛发可以配合口服抗菌素。一般毛囊炎不会自愈，一定要用抗菌药物或者局部清洁消毒来达到治疗目的。
毛囊炎是可以治愈的，建议使用全身疗法：在皮损广泛而有明显脓头时，应给广谱抗生素治疗。如有条件可送脓液培养，并作药敏试验，这样对选择更有效的药物有重要的指导意义。免疫疗法：慢性反复发作的患者，可用疖病菌苗注射，每周皮下注射一次，开始剂量为0。5毫升，第二次为1毫升，第三次为1。5毫升，以后每次为2毫升。
毛囊炎就是毛囊部发生的急性、亚急性或慢性化脓性，或者是非化脓性的炎症，本病在临床上比较常见。化脓性主要是葡萄球菌引起的，是因为搔抓抓破了皮肤，引起了葡萄球菌的感染。另外一种叫非化脓性，多与职业有关系，如果长期接触煤焦油类，或者是长期用皮质类固醇的激素，以及经常在湿的环境中工作的工人，就容易发生非化脓性的毛囊炎。毛囊炎的治疗如果是单个很小发生，有抵抗力一般会自己好。如果出现症状加重，红肿热痛加重，甚至出现发烧的情况下，就必须进行系统的治疗。比如口服抗生素，还有一些物理的治疗方法，紫外线的照射、激光的照射，还有外用药物的治疗，这个样子才能把这个比较严重的毛囊炎治好。