发际线种植是一项简单的微创手术，一般是不会出现什么副作用的。发际线种植后会感觉到后脑勺有麻木感和疼痛感，这是由于发际线种植手术需要切下后脑勺处的毛囊，所以后脑勺部的神经也会有些许损伤，因此一些植发者会在发际线种植术后会感觉到有麻木感和疼痛感。
有很多人在种植发际线后抱怨种发际线后有头发加速脱落的后遗症，其实这是由于毛囊的生长环境发生改变，且毛囊从真皮层提取出来，受到外界的影响使得部分毛囊脱落期提前导致的。一般三个月内会停止脱落，毛囊会重新长出新的更加健康的头发。
很多人都误以为植发部位头发脱落也是发际线种植的后遗症，实际上头发是会一边长一边脱，整体稀疏效果并不是很明显，对于形象的影响也不会很大。还有就是要做好植发手术后的护理工作，术后的护理对于头发最后的效果也是有很大的影响的。